全国有6700多个水功能区，达标率偏低。2009年普查全国水功能区的达标率仅仅是47.4%，海河、辽河缺水流域的达标率还不到40%。如北方的海河流域超载60%，南方的珠江流域超载40%以上，水质采样后发现污染已经不是缺水地区的专利。部分河流汛期水质也恶化，像海河流域2005年前汛期过去后水质会好一点，但现在水质严重恶化。