2006年2月國家統計局公布，我國七大水係的411個水質監測斷麵中，有41%的斷麵滿足國家地表水3類標準，比上年下降1個百分點；32%的斷麵為4～5類水質，上升2個百分點；超過5類水質的斷麵比例占27%，下降1個百分點。

2003年度七大水係407個重點監測斷麵中，38.1%的斷麵滿足Ⅰ～Ⅲ類水質要求，32.2%的斷麵屬Ⅳ、Ⅴ類水質，29.7%的斷麵屬劣Ⅴ類水質。其中七大水係幹流的118個國家控斷麵中，Ⅰ～Ⅲ類水質斷麵占53.4%，Ⅳ、Ⅴ類水質斷麵占37.3%，劣Ⅴ類水質斷麵占9.3%。各水質幹流水質好於支流水質。

海河水係汙染嚴重，劣Ⅴ類水質斷麵占50%以上；遼河水係總體水質較差，劣Ⅴ類水質斷麵占40.6%；黃河水係總體水質較差，支流汙染普遍嚴重；淮河幹流以Ⅳ類水體為主，支流及省界河段水質仍然較差；鬆花江水係以Ⅳ類水體為主；珠江水係、長江幹流及主要一級支流水質良好，以Ⅱ類水體為主。

按照綜合汙染指數比較，2003年度七大水係汙染程度由重到輕依次為：海河、遼河、黃河、淮河、鬆花江、長江、珠江。

與上年相比，海河、遼河和淮河汙染程度略有減輕，鬆花江、珠江和黃河支流汙染加重。

七大水係主要呈現為有機汙染，主要汙染指標是石油類、生化需氧量、氨氮、高錳酸鹽指數、揮發酚等。

主要水係

長江水係 國控監測斷麵103個，其中Ⅰ～Ⅲ水質比例占71.8%，Ⅳ～Ⅴ類占17.5%，劣Ⅴ類占10.7%。

長江水係的主要汙染指標是石油類、氨氮。

黃河水係 黃河水係總體水質屬中度汙染，44個國控監測斷麵中，劣Ⅴ類水體占38.7%。幹流22個斷麵中Ⅱ～Ⅲ類水質占31.8%、Ⅳ～Ⅴ類占54.6%、劣Ⅴ類占13.6%，幹流水質好於支流。

主要汙染指標為石油類、氨氮和高錳酸鹽指數。

珠江水係 珠江水係水質總體良好。33個國控監測斷麵中，81.8%的斷麵為Ⅰ～Ⅲ類水質，12.1%的斷麵屬Ⅳ類水質，6.1%的斷麵屬劣Ⅴ類水質。

主要汙染指標是揮發酚、氨氮和石油類。

鬆花江水係 41個國控監測斷麵中，Ⅲ～劣Ⅴ類水質比例分別為：7.7%、64.1%、10.3%和17.9%。